南非种族隔离（南非语：Apartheid），为1948年至1994年间南非在国民党执政时实行的一种种族隔离制度，当时占大多数的黑人，其包括集会、结社的各项权利受到大幅限制，维持欧洲移民阿非利卡人的少数统治。 南非的种族隔离早在荷兰统治时就已经开始。十九世纪的英裔南非商人塞西尔·罗德斯在取消黑人及有色人种的权利上扮演重要的角色，他设立了第一个种族隔离的法案。种族隔离是在二次世界大战后开始倡导，主要是为了治安的原因，当时执政党就是以阿非利卡人为主的南非国民党，也在当地由南非托管的西南非实施，一直到1990年西南非独立成为纳米比亚共和国为止。在1948年南非普选时开始成为正式的政策。政府将居民分为四个种族：黑人、白人、有色人种及印度人，而有色人种及印度人又有更细的分类，各种族住在不同的区域中。在1960年至1963年，350万非白人的南非人被驱离他们原来的家园，被迫进入隔近被分隔的区域中，这是近代史上大型的驱离行动之一，当时南非政府计划搬迁人口之后要把这些地方逐出南非独立，所以这样的分化政策1970年起达到高峰，甚至废除非白人的部分政治权利，那时也开始剥夺黑人的南非公民身份，在法律上他们成为地方分权的十个班图斯坦中的公民，将其政治权限缩在“国中国”内，其中四个成为名义上的独立国家。南非政府在教育、医疗、海滩及其他公共服务都实行种族隔离政策，而黑人得到的服务往往会比白人要差。

种族隔离带来国内明显的南非国内对种族隔离的反对及暴力，也因此国际长期对南非禁运（包括武器禁运）。自1950年代起，一系列的黑人民众起义及抗议事件，使得反种族隔离被禁止，反种族隔离领袖入狱。随着抗议的扩散，越来越军事化，政府的回应是压制及暴力。国际组织更对南非制裁，南非政府的处境也更加艰难。1980年代由于经济的压力，白人政府开始改革种族隔离政策，但争议仍在。总统弗雷德里克·威廉·戴克拉克自1989年开始取消一些种族隔离的相关法令，并在10月起开始释放曼德拉及其他政治犯。1990年开始结束南非种族隔离的谈判。在1991年时种族隔离政策及一些尚未废止的相关法令被正式废除，不过非白人在1993年才有资格投票，最后在1994年多民族的民主选举中，由曼德拉带领的非洲人国民大会胜出，1994年的多民族选举也被看作是南非种族隔离制度正式终结。