曼戈苏图·布特莱齐和哈里·施瓦茨于1974年签署的《马赫拉巴蒂尼信仰宣言》强调了和平过渡权力及人人平等的原则，是南非黑人与白人政治领导人首项达成的此类协议。1989年，波塔宣布辞职，由弗雷德里克·威廉·德克勒克接任国家总统。

1990年，德克勒克政府宣布解除对非国大及其他反种族隔离组织的禁令，迈出摒弃歧视的第一步。德克勒克任内以民主改革的方式与非国大协商，同时促进南非共产党及非国大的合法化，而政府亦释放了先后在罗本岛、波尔斯穆尔及维克托·韦斯特三个监狱服刑共27年的纳尔逊·曼德拉。接下来是进行谈判的过程，再经过多数白人选民公投的批准后，政府废除了种族隔离立法。随着国际社会压力增大及逐渐实现种族平等，南非同意让其统治近75年的西南非洲独立。1990年2月9日，纳米比亚制订了其宪法。3月21日，纳米比亚正式宣布从南非统治下独立。同年，南非亦宣布摧毁其核武库，并于1991年加入《不扩散核武器条约》。1993年，时任国家总统德克勒克与曼德拉就政策及政府的过渡进行了双边讨论。1994年3月1日，南非将鲸湾港与企鹅群岛移交给纳米比亚。4月，南非举行首次不分种族的选举，曼德拉领导的非国大以压倒多数获胜。自1994年以来，非国大一直执政。除此之外，南非亦重新加入了英联邦，并成为南部非洲发展共同体的成员。

在南非后种族隔离时期，由于面临许多变化，南非失业率一直居高不下。虽然有许多黑人已经上升到中上阶层，但黑人的整体失业率仍然在1994年至2003年间恶化，至于种族隔离结束前罕见的贫穷白人则有所增加。此外，现任政府一直在努力实现货币与财政纪律，以确保财富再分配及经济增长。自从1994年非国大领导的政府上台以来，南非在联合国的人类发展指数中的名次一直下降，直到1990年代中期才重新稳步上升。有些可能归因于艾滋病与病毒在南非的大流行，以及政府早年未能采取政策来解决这个问题。

2008年5月，南非的骚乱造成至少60人死亡。住房权利与驱逐中心估计，超过10万人因而被赶出家园。虽然骚乱针对的目标主要是寻求庇护的移民及难民，但有三分之一的受害者是南非公民。在2006年的一项调查中，南非移民项目认为，南非人比世界其他地方的人更反对移民。联合国难民署在2008年的报告指出，在南非申请庇护的难民已经超过200,000人，几乎是前一年的四倍。这些人主要来自津巴布韦，但也有许多人来自布隆迪、刚果民主共和国、卢旺达、厄立特里亚、埃塞俄比亚以及索马里。就业、商业机会、公共服务及住房的竞争导致难民与收容社区之间出现紧张局势。尽管仇外心理仍然是一个问题，但最近的暴力行为已经没有最初的恐惧那么普遍。尽管如此，随着南非继续努力解决种族问题，所提出的解决方案之一就是通过立法，例如有待立法的《仇恨犯罪与仇恨言论法案》，以维护南非对种族主义的禁令以及对平等的承诺。